Совет молодых ученых ФГБНУ НЦПЗ является постоянно действующим коллегиальным совещательным органом и представляет собой собрание молодых ученых Центра, формирующее и проводящее молодежную политику, защищающее их интересы в профессиональной и социально-бытовой сферах.
Совет молодых ученых содействует профессиональному росту, развитию научных инициатив и закреплению молодых научных кадров в Центе, внедрению результатов исследований молодых ученых и специалистов в практическое здравоохранение. Принимает участие в поддержании научной преемственности, сохранении научных школ и направлений, а так же организует информационное обеспечение научной молодежи, предоставляет информацию о вакансиях, фондах, грантах, конференциях, школах и иных мероприятиях по поддержке научных молодых кадров. Совет молодых ученых активно участвует в организации и проведении научных конференций молодых ученых и специалистов Центра, а так же работу студенческого научного кружка.